A construção do novo Museu Francisco Lacerda surgiu da necessidade de requalificar a antiga Fábrica Marie D’Anjou. Consistiu na criação de três polos: um para a Administração e gabinetes técnicos; um para as exposições de longa duração; e um terceiro polo que integra as zonas principais da receção e acolhimento dos visitantes, uma sala de exposições temporárias, um auditório, uma biblioteca e, ainda, a zona das reservas museológicas com acesso reservado.